Heroes conta a história de um grupo de pessoas comuns de diferentes partes do mundo que começam a descobrir habilidades extraordinárias. Enquanto um eclipse total acontece, um professor de genética, Mohinder Suresh, é guiado pelo desaparecimento do pai a descobrir uma teoria secreta de que existem pessoas com poderes extraordinários vivendo entre nós. No Japão, Hiro Nakamura, um simples funcionário de escritório é capaz de parar o tempo. Em Los Angeles, um policial decepcionado com a vida, Matt Parkman, começa a escutar o pensamento das outras pessoas. Peter Petrelli, um jovem sonhador, tenta convencer seu irmão, Nathan, de que ele pode voar. Uma líder de torcida, Claire Bennet, descobre ser indestrutível. Uma stripper de Las Vegas, Nikki Sanders, percebe que sua imagem no espelho tem um segredo. Isaac Mendez, um talentoso artista, pode pintar o futuro. O que eles não sabem é que estão um passo à frente na evolução da humanidade e que seus destinos já foram traçados. Os mistérios e segredos destes verdadeiros heróis são desvendados a cada episódio.
In His Own Image Neste episódio, somos apresentados a Peter Petrelli, um jovem que sonha que consegue voar, e seu irmão, um político que pensa que Peter está desperdiçando sua vida. Enquanto isso, pessoas comuns ao redor do mundo começam a desconfiar que possuem habilidades extraordinárias. O artista Isaac Mendez acredita ser capaz de pintar o futuro, a animadora de torcida Claire Bennet é capaz de se recuperar de qualquer ferimento quase instantaneamente. O japonês Hiro Nakamura tenta convencer um amigo que de que ele consegue viajar no tempo e no espaço, e a mãe solteira Niki Sanders começa a ter visões estranhas em espelhos. Ainda se recuperando da morte do pai, o professor de genética Mohinder Suresh começa a ler as pesquisas do pai para tentar descobrir por que ele foi morto. Quando ele segue as pistas do pai em direção a Nova Iorque, Mohinder descobre que alguém está no encalço da mesma pesquisa. Alguém que é capaz de matar para proteger os segredos do próximo passo na evolução humana.
O policial de Los Angeles Matt Parkman está trabalhando em uma cena de crime quando, sozinho, começa a ouvir o choro abafado de uma garotinha vindo de algum lugar da casa. O heroísmo de Claire traz atenção indesejada. Peter chega mais perto da verdade sobre o poder dele e de seu irmão. Hiro encontra uma história em quadrinhos que o leva até Isaac.
O momento romântico de Claire com um jogador de futebol americano toma um rumo trágico. Hiro convence seu amigo, Ando, que é destino dos dois viajar para os Estados Unidos para salvar o mundo. Enquanto isso, Nathan usa o acidente de Peter para se promover politicamente. O policial Matt Parkman, Mohinder Suresh e o FBI procuram por Sylar.
Depois de passar uma noite com Brody, Claire acorda no último lugar que podia imaginar. Matt conhece dois homens que parecem saber demais sobre ele. Mohinder Suresh encontra um dos heróis. A assistente de Linderman dá mais trabalho para Niki justo quando Nathan chega em Las Vegas para conversar com um dono de cassino sobre uma contribuição para sua campanha. Isaac pinta um futuro arrepiante para Claire. Peter recebe uma mensagem codificada de uma fonte muito inesperada.
Matt usa suas habilidades para salvar seu casamento. Niki, confusa depois de outro <i>blackout</i>, chega em casa e fica sabendo que seu marido, D.L., escapou da prisão. Claire conta a seu pai sobre as coisas pelas quais ela tem passado recentemente. Hiro finalmente entra em contato com outro herói. Peter precisa descobrir o que fazer com a misteriosa mensagem.
Hiro e Ando planejam continuar na jornada para Nova Iorque, mas eles recebem uma tentadora oferta enquanto ainda estão em Las Vegas. Mr. Bennet, pai de Claire, arranja uma reunião para sua filha conhecer seus pais biológicos. Claire espera que esse encontro possa esclarecer suas habilidades. Hiro liga novamente para Isaac, mas Peter atende e está disposto a esclarecer a mensagem do futuro. Mohinder retorna a Índia para enterrar seu pai. Niki recebe uma visita surpresa em sua casa.
Niki se abre para um amigo quando seu filho torna-se o motivo de uma crise. Hiro supera suas dúvidas sobre o heroísmo. Nathan e sua esposa planejam uma estratégia para vencer as eleições e, inesperadamente, Peter oferece assistência. Claire descobre o que aconteceu com a sua fita de vídeo desaparecida. Matt e Audrey continuam investigando o <i>serial killer</i> Sylar.
Enquanto está de luto por seu pai na Índia, Mohinder começa a ter estranhos sonhos do seu passado. Niki começa a entender a si mesma. Hiro e Ando conhecem uma pessoa interessante quando param em uma lanchonete. Matt e Audrey seguem uma pista que diz respeito a Sylar, mas ela leva a algo inesperado. Claire está se preparando para a volta às aulas, esperando que sua vida volte ao normal. Enquanto isso, seu pai localiza outro herói, e pede sua ajuda com urgência.
Os acontecimentos desse episódio ocorrem no dia do jogo de volta às aulas do colégio de Claire. O pai de Claire fica cada vez mais desesperado para parar o vilão que está atrás de Claire. Nathan consegue o quadro de Linderman e fica aterrorizado pelo o que ele mostra. Os sonhos de Mohinder contêm segredos sobre seu pai. Ando espera por Hiro, que ainda não retornou do passado. Peter precisa tentar salvar a animadora de torcida e a si mesmo.
Este episódio mostra os personagens seis meses atrás. Chandra Suresh, pai de Mohinder, chega à Nova Iorque procurando por pessoas especiais. Ele encontra um homem que agarra a chance de ser uma pessoa singular. Peter se forma no curso de enfermagem. Nathan planeja participar de um caso que pode causar complicações para os Petrellis. Niki recebe a visita de seu pai, que traz a tona o pior lado dela. Hiro tenta alterar o futuro por alguém importante para ele. Claire descobre suas habilidades logo depois de se tornar uma animadora de torcida, e seu pai encontra alguém especial.
Depois de ser preso por engano em Odessa, Peter fica sob custódia policial, obrigando Nathan a largar um pouco sua campanha para o Congresso. Claire lida com as implicações de contar a verdade a seu pai. Matt e Audrey perseguem uma nova pista na caçada por Sylar, sem saberem que ele foi capturado pelo Mr. Bennet. Hiro e Ando chegam a Odessa, tarde demais para “salvar a <i>cheerleader</i>”. Depois que Niki fica sabendo das últimas coisas que Jessica fez, ela precisa tomar uma difícil decisão pela segurança de sua família – ela decide se entregar a polícia. Mohinder avança em seu caminho quando volta a Nova Iorque e continua a pesquisa de seu pai. O quadro de Isaac em que um homem explode tem grandes conseqüências para o futuro de um herói em particular.
Matt conta sobre suas habilidades para a esposa. Agora que sabe da verdade, Claire tenta entender mais sobre sua vida. Hiro procura a espada que está destinada a pertencer a ele. Niki precisa encarar as conseqüências de ter se entregado para a polícia. Simone e Nathan estão preocupados com Peter, que está em coma há duas semanas. Peter conhece outro herói. Micah visita sua mãe, Niki.
Hiro continua a procurar pela espada enquanto é perseguido por estranhas pessoas. Um homem invisível chamado Claude tem algo a ensinar para um dos heróis. D.L. assume responsabilidades familiares, e Matt abre o jogo com sua esposa. Mr. Bennet continua concentrado na captura de Sylar. Claire procura pelo haitiano e por seus pais biológicos. Mohinder tenta encontrar as pessoas que estão na lista e recebe uma visita surpresa. Um psiquiatra oferece ajuda a Niki.
Hiro precisa explicar seu novo caminho heróico para sua ambiciosa irmã e seu pai magnata. Niki tem a chance de se juntar a D.L. e a Micah. O trabalho de Claude com Peter leva o rapaz a questionar as pessoas mais próximas a ele. Claire vai atrás de sua mãe biológica em um trailer. Sylar se disfarça e age contra Mr. Bennet.
Matt entra no ramo da segurança privada e é contratado por um condenável cliente. Suresh encontra outra pessoa da lista. Como sua vida dentro de casa só piora, Claire tenta descobrir mais sobre seus pais biológicos. Hiro e Ando são seguidos em Las Vegas enquanto procuram pela espada. Nathan é obrigado a lidar com um segredo do passado. Ainda em débito com Mr. Linderman, Jessica usa métodos desagradáveis que podem significar a morte para um colega herói.
Peter entende que ele e Claude podem ter sido traídos. Matt se reúne com o radioativo Ted Spague e Hana Gitelman, uma mulher que tem o poder mental de enviar mensagens “sem fio”. Hiro toma uma difícil decisão sobre sua missão. Claire não consegue mais segurar sua raiva contra Mr. Bennet.
Matt Parkman e Ted Sprague chegam ao Texas procurando por respostas, e fazem Mr. Bennet e sua família de reféns. São reveladas informações sobre Mr. Bennet, a agência para qual ele trabalha, e como ele encontrou Claire.
Conforme as eleições e a destruição de Nova Iorque se aproximam, Nathan se encontra com Linderman. Hiro tenta roubar a espada, o que o leva a um novo caminho. Suresh e Sylar fazem progressos com a lista a um preço alto. D.L. começa a suspeitar de problemas na casa. Isaac pinta um quadro ainda mais aterrorizante. Uma nova heroína, Candice Wilmer, aparece.
Sylar e Peter se confrontam. Linderman revela seus planos a Nathan, e conta com o apoio de outro herói. Claire finalmente conhece seu pai biológico, e Bennet, Matt e Ted tentam escapar de Thompson.
Hiro e Ando se encontram cinco anos depois da destruição de Nova Iorque. As pessoas com habilidades extraordinárias são taxadas como terroristas, registradas, caçadas e mortas. Hiro e Ando se encontram com versões sombrias dos outros heróis, na preparação para uma revelação com o presidente. Isso inclui uma versão sombria de Matt, uma Jessica/Niki com uma clara personalidade vencedora nessa batalha, uma Claire morena, e um homem texano chamado Andy.
Jessica e D.L. descobrem algumas das coisas que Linderman quer deles e de Micah. Sylar questiona seu destino quando percebe o que está predestinado a fazer e se encontra com sua mãe para procurar conforto. Hiro e Ando seguem Sylar, e a determinação de Hiro é testada quando ele percebe o peso de matar outro ser humano. Enquanto isso, Angela Petrelli tenta convencer Nathan a cooperar com o plano de Linderman. Peter tenta provar para Claire que os dois estão destinados a salvar Nova Iorque. Além disso, há um novo herói que pode guardar a chave para parar Sylar.
Angela Petrelli é forçada a ter um papel maior nas vidas de Nathan, Peter e Claire. A verdade sobre a morte do pai de Nathan e Peter é finalmente revelada, junto com sua real identidade. Quando Nathan descobre que pode ter chances de se tornar mais do que um senador, ele precisa tomar uma decisão. Conforme as eleições se aproximam, alguns tentam deixar Nova Iorque. Mr. Bennet e Matt descobrem outro segredo surpreendente. Sylar come o cérebro de outro herói. O pai de Hiro retorna.
Os heróis conseguirão parar Sylar? Nathan compactuará com as visões de Linderman? O que Peter terá que sacrificar para salvar o mundo? Com todas as terríveis previsões diante deles, os heróis encaram momentos de dor e perigo no <i>Kirby Plaza</i>.